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小貝戰(zhàn)“疫”：當(dāng)抗病毒藥物篩選遇上自動(dòng)化工作站

貝克曼庫(kù)爾特生命科學(xué) 2020-02-24 | 閱讀：1809

近日，我國(guó)研究人員評(píng)估了幾種廣譜抗病毒藥物對(duì)新型冠狀病毒SARS-Cov-2的抑制作用。¹細(xì)胞實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，瑞德西韋和鹽酸氯喹的半數(shù)有效濃度EC₅₀分別為0.77 uM和1.13 uM，

選擇系數(shù)SI分別大于129和88。這表明它們?cè)诩?xì)胞水平能夠有效抑制SARS-Cov-2的感染。

事實(shí)上一個(gè)抗病毒藥物絕非朝夕煉成，需要經(jīng)歷體外實(shí)驗(yàn)、體內(nèi)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、臨床試驗(yàn)的一系列研究歷程，周期長(zhǎng)、投入大、風(fēng)險(xiǎn)高。體外實(shí)驗(yàn)處于藥物發(fā)現(xiàn)的早期，是非常重要的基石步驟。通過(guò)細(xì)胞模型對(duì)化合物的細(xì)胞毒性和病毒抑制能力進(jìn)行篩選，能夠定量地評(píng)價(jià)其有效性，也可以排除不必要的藥物化學(xué)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)、篩選，或者后續(xù)體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的前期投入。

類(lèi)似于對(duì)瑞德西韋和鹽酸氯喹的實(shí)驗(yàn)，測(cè)試現(xiàn)有的抗病毒藥物對(duì)新型冠狀病毒的藥效，是對(duì)新型冠狀病毒這樣突發(fā)疫情的一條高效路徑。同時(shí)，開(kāi)展對(duì)大量先導(dǎo)化合物庫(kù)的高通量篩選，也將是發(fā)展抗新型冠狀病毒藥物的重點(diǎn)工作。

隨著篩選通量和復(fù)雜程度的增加，自動(dòng)化工作站已逐漸成為藥物篩選的重要手段。Biomek自動(dòng)化工作站可以有效地管理實(shí)驗(yàn)流，處理多類(lèi)型、多進(jìn)程的高通量實(shí)驗(yàn)。與傳統(tǒng)的人工實(shí)驗(yàn)相比，Biomek工作站能夠有效節(jié)省人力，標(biāo)準(zhǔn)化工作流，縮短研發(fā)周期，提高研發(fā)效率。

【自動(dòng)化的抗病毒藥物篩選方案】

絕不僅僅是移液

無(wú)菌、振蕩、溫控、儲(chǔ)存、孵育，全都可以有

讀板檢測(cè)、在線(xiàn)離心、細(xì)胞計(jì)數(shù)、大體積分液，也都可以有

我們還有

- 開(kāi)放的儀器設(shè)計(jì)，輕松實(shí)現(xiàn)拓展整合

- 軟件工具支持?jǐn)?shù)據(jù)的采集、保存與溯源

- 工作流的時(shí)序優(yōu)化，實(shí)現(xiàn)多進(jìn)程、無(wú)人值守實(shí)驗(yàn)

- 紅外光幕自動(dòng)感應(yīng)防護(hù)，內(nèi)置攝像頭捕捉出錯(cuò)瞬間

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小貝的藥篩方案可輔助完成：

- 高通量先導(dǎo)化合物初篩

- 化合物次級(jí)篩選

- 藥物靶點(diǎn)量效關(guān)系

- 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)

- 細(xì)胞培養(yǎng)

- 化合物庫(kù)管理

Biomek自動(dòng)化工作站已經(jīng)應(yīng)用到抗菌化合物²，SARS冠狀病毒抑制物³，甲型流感病毒

H3N2抑制物⁴等藥物篩選。自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)和手工實(shí)驗(yàn)的IC₅₀值高度一致。

參考

1. Wang M., Cao R., Zhang L. et al. Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in vitro. Cell Res (2020).

2. Forry S. P., Madonna M. C., López?Pérez D. et al. Automation of antimicrobial activity screening. AMB Expr (2016) 6:20. DOI: 10.1186/s13568-016-0191-2

3. Severson W. E., Shindo N., Sosa M. et al. Development and Validation of a High-Throughput Screen for Inhibitors of SARS CoV and Its Application in Screening of a 100,000-Compound Library. Journal of Biomolecular Screening 12(1); 2007. DOI: 10.1177/1087057106296688

4. Severson W. E., Mcdowell M., Ananthan S. et al. High-Throughput Screening of a 100,000-Compound Library for Inhibitors of Influenza A Virus (H3N2). Journal of Biomolecular Screening 13(9); 2008 DOI: 10.1177/1087057108323123

*本文涉及的內(nèi)容與產(chǎn)品僅用于科研和工業(yè)，不用于臨床診斷。